Bölümümüz mezunları, Üniversitemiz Fen Bilimleri Enstitüsüne bağlı Balıkçılık Teknolojisi Mühendisliği, Biyoloji ve Kimya Anabilim Dallarında yüksek lisans ve doktora, Çevre Bilimleri, Deniz Ulaştırma İşletme Mühendisliği, İstatistik ve Jeoloji Mühendsiliği anabilim dallarında ise yüksek lisans yapabilirler. Lisansüstü eğitime giriş her yarıyıl başında Üniversitemiz Fen Bilimleri Enstitüsü'nün belirlediği prıogram ve koşullar çercevesinde yapılmaktadır.